«Trop de cuisiniers gâtent la sauce » dit un proverbe allemand, mais pour mener à bien ce projet transfrontalier de reprise du trafic ferroviaire de voyageurs entre Mulhouse et Müllheim de nombreux partenaires ont uni leurs forces :
En premier lieu les propriétaires: du côté français, Réseau Ferré de France (RFF) est propriétaire de la voie ferrée, tandis que côté allemand, c’est la Deutsche Bahn « Réseau » AG (DB Netz AG).Ces deux partenaires assuraient de part et d’autre de la frontière la maîtrise d’ouvrage, conduisaient les études et la mise en œuvre du block automatique et participaient au financement du projet.
La Région Alsace comme autorité organisatrice du transport régional et le Zweckverband Regio-Nahverkehr (ZRF) sont les cofinanceurs régionaux du projet, particulièrement impliqués dans la réouverture de la ligne au transport ferroviaire de voyageurs. Du côté allemand, le projet fait partie du plan régional de transports en commun:Integriertes regionales Nahverkehrskonzept Breisgau-S-Bahn , qui couvre le territoire des arrondissements (Landkreise) de Brisgau-Haute-Forêt-Noire (Breisgau-Hochschwarzwald) et d’Emmendingen, ainsi que de la Ville de Fribourg. De plus, le ZRF était « porteur du projet » de block automatique cofinancé dans le cadre d’INTERREG, c’est-à-dire qu’il assurait la coordination interne et financière entre l’autorité de gestion du programme INTERREG et les partenaires du projet. Du côté français, le projet de réouverture de la ligne au trafic ferroviaire de voyageurs a été inscrit au Contrat de projets Etat-Région 2007-2013 et est donc financé en grande partie par l’Etat et la Région Alsace. Le Ministère, en tant qu’autorité organisatrice des transports ferroviaire de voyageurs du Land de Bade-Wurtemberg était l’autre cofinanceur du projet.
Le Secrétariat technique commun et l’autorité de gestion interviennent dans l’application du programme INTERREG IV Rhin supérieur, en particulier pour les aspects financiers et le suivi du projet, de la phase de demande de concours communautaire jusqu’à la réalisation du projet, et organisent les versements des fonds attribués par l’UE.